写出了《天体运行论》的哥白尼，他自始至终都是一个虔诚的天主教徒，可他用科学的观察否定了天主教会毫无根据却又影响深广的旧有知识。
他对宗教的虔诚达到什么程度呢？让我们从他那部杰作《天体之运行：导言》里找出他作的答复吧。他在《导言》里是这样写的：“如果真有一种科学能够使人心灵高贵，脱离时间的污秽，这种科学一定是天文学。因为人类果真见到天主管理下的宇宙所有的庄严秩序时，必然会感到一种动力促使人趋向于规范的生活，去实行各种道德，可以从万物中看出来造物主确实是真美善之源。”
在哥白尼别的著作里同样充满了天主的名字以及天主的智慧与慈爱。他一生维护着天主教的信仰，他对从天主教的革命出的新教派给予了反击。
哥白尼死于1543年，享年七十岁。死前他为自己预作墓志铭，其铭文：“你不必赏我像赏给圣保禄的恩宠，但求你赏赐我像你给圣伯多禄的宽赦和右盗的仁慈。”
一直以反基督教著称的思想家罗素也这么评价哥白尼：“哥白尼是一位波兰教士，抱着真纯无暇的正统信仰……他的正统信仰很真诚，他不认为他的学说与《圣经》相抵触。”（《西方哲学史》）

作为经济学家，哥白尼是一位很有趣的人。他的经济管理才干使他成为一位好主人和有能力的组织者，他还善于将这方面的实践经验应用到理论研究中去。他在理论上探讨的问题，并不是脱离具体实践的哲学投机，而是和可预见的经济发展密切相关的问题。哥白尼把经济现象看做是客观规律作用的结果，并采用科学研究方法探索经济规律。哥白尼虽然是一位神职人员和法律学者，但在经济研究中，却摆脱了宗教和法学观点的束缚和影响。他考虑的是广大社会阶层的经济利益，而不单纯是封建贵族阶级的利益，因此哥白尼是当时先进的市民阶层利益的代言人。当时市民阶层反对在经济和社会生活中占据统治地位的封建关系。他的改革设想是针对封建管理理论的，他努力用符合新经济形势的新理论去取代那些封建理论。在当时，他的经济模式是先进的和富有创新精神的。在这种模式中他没有考虑封建阶级的利益，虽然他本人作为瓦尔米亚的神甫也属于这个阶级。他考虑的首先是手工业者和他常说的创造财富的人们的利益，而这些人正是封建贵族所蔑视的劳动者。他代表着主要由封建主组成的改革派，但他的主张并不是为巩固封建主义服务的，而是为他出身的那个市民阶层服务的。贫苦人尊崇哥白尼，并把他看做是自己的庇护者和代言人。作为神甫会财产管理人、封建主大人、神职人员和医生，他用自己的智慧和力量为贫苦人民服务了一生。